Первого декабря 2011 года на основании приказа Председателя Правления АО «Университета КАЗГЮУ» Нарикбаева Т.М., № 1-367-1/11 создан Центр повышения квалификации судебных экспертов. Согласно приказа № 1-205\12 от 14.07. 2012 года Центр преобразован в Институт судебной экспертизы. Директором Института является доктор юридических наук, профессор Сейтенов Калиолла Кабаевич, главным специалистом — Салиенко Василий Васильевич, ведущим специалистом — Салюков Рустем Равильевич.
Институт судебной экспертизы представляет собой современную экспертную школу и является научно-методическим центром развития системы подготовки, переподготовки и повышения квалификации государственных служащих органов юстиции и сотрудников правоохранительных органов, использующей передовые методы и технологии обучения, готовящей конкурентоспособных специалистов с высоким уровнем компетенции, развивающей на научные исследования и разработки, эффективно реализуя их результаты в системе государственной службы.
Подготовлены и заключены Меморандумы о сотрудничестве между Университетом КАЗГЮУ и:
-Генеральной прокуратурой Республики Казахстан;
— Министерством внутренних дел Республики Казахстан;
— Центром судебной экспертизы Министерства юстиции Республики Казахстан;
— Центральной таможенной лабораторией Комитета государственных доходов Министерства финансов Республики Казахстан,
— Министерством внутренних дел Республики Казахстан.
Для укрепления международных связей и активизации сотрудничества в сфере судебно-экспертной деятельности и взаимодействия судебно-экспертных учреждений, научной общественности и образовательных учреждений Евразийского Экономического Союза подписаны:
— Соглашение о сотрудничестве и укреплению взаимных контактов между Университетом КАЗГЮУ и ФБУ Российский Федеральный центр судебной экспертизы при Министерстве юстиции Российской Федерации;
— Соглашение о сотрудничестве и укреплению взаимных контактов между Университетом КАЗГЮУ и ГУ «Научно-практический центр Государственного комитета судебных экспертиз Республики Беларусь»;
— Протокол о сотрудничестве в области образовательной и научной деятельности между Университетом КАЗГЮУ и Федеральным государственным казенным образовательным учреждением высшего профессионального образования «Волгоградская академия МВД России».
Для проведения качественного обучения студентов, обучающихся по специальностям «Юриспруденция» и «Правоохранительная деятельность» и магистрантов по группе специальностей «Право», заключены соответствующие Договора с Главным экспертно-криминалистическим центром МВД Республики Беларусь и Федеральным государственным бюджетным образовательным учреждением высшего профессионального образования «Московская государственная юридическая академия имени О.Е. Кутафина», Государственным Федеральным Образовательным Учреждением ВГСПУ.
Издан учебник «Судебно-почерковедческая экспертиза рукописей, выполненных на казахском языке» и учебно-практическое пособие «Осмотр места происшествия» из серии «Библиотека следователя».
Совместно ведущими учеными Университета КАЗГЮУ и Волгоградской академии МВД России изданы учебники: «Химия металлов на службе криминалистики» и «Химия для криминалистов».
Совместно профессорско-преподавательским составом Волгоградской академии МВД России и Университета КАЗГЮУ осуществляется работа по разработке и написанию учебника «Инновационные технологии в криминалистике».
На базе Института учебные занятия проводятся в соответствии с рабочими учебными программами, с привлечением ведущих ученых-практиков ближнего и дальнего зарубежья. На занятиях используются современные образовательные технологии, мультимедийные презентации и их компьютерное обеспечение, применяются новейшие экспертные методики исследования объектов экспертизы. Кроме традиционных вопросов рассматриваются актуальные темы, связанные с производством комплексных межведомственных экспертиз с участием судебных экспертов.
В Институте разработано учебно-методическое обеспечение учебного процесса, ведется работа по созданию электронной базы нормативных правовых актов и специальной литературы в области судебной экспертизы и криминалистики.

Приоритетными задачами Института судебной экспертизы являются:

• удовлетворение потребностей Генеральной Прокуратуры Республики Казахстан, Министерства внутренних дел Республики Казахстан и Центра судебной экспертизы Министерства юстиции Республики Казахстан РК в повышении квалификации, подготовке и переподготовке сотрудников правоохранительных органов и судебных экспертов;
• осуществление взаимодействия по обмену международным опытом в образовательной и научной деятельности по вопросам развития международного сотрудничества в сфере обучения;
• организация повышения квалификации и профессиональной подготовки сотрудников государственных органов, организаций и учреждений.
  Целью повышения квалификации является обновление теоретических и практических компетенций по актуальным темам в области уголовного процесса, судебной экспертизы и криминалистики.

Одним из направлений миссии Института судебной экспертизы Университета КАЗГЮУ является подготовка высокопрофессиональных и компетентных сотрудников правоохранительных органов и судебных экспертов, способных к эффективной компетентной деятельности в области судебной экспертизы и криминалистики.
Деятельность Института осуществляется по следующим направлениям:
— формирование учебной и методической базы для проведения обучающих семинаров, курсов повышения квалификации, подготовки и переподготовки сотрудников правоохранительных органов;
— проведение обучения судебных экспертов органов юстиции, сотрудников органов прокуратуры, органов внутренних дел и таможенной службы.
Отделом Атташе по правовым вопросам Федерального Бюро Расследований Посольства Соединенных Штатов Америки на базе Института проведены учебные курсы со специалистами взрывниками Комитета национальной безопасности РК и Министерства внутренних дел РК по темам: «Расследование последствий взрывов», «Взрывные вещества и самодельные взрывные устройства», а также «Финансирование международного терроризма». Для проведения занятий были привлечены Специальные Агенты ФБР США, сотрудники правоохранительных органов и Института судебной экспертизы.
В Клубе ученых «Академик» Университета КАЗГЮУ Институтом проведены заседания Круглого стола на тему: «Развитие института специальных знаний в проекте нового Уголовно-процессуального кодекса Республики Казахстан» и «Актуальные проблемы традиционных криминалистических экспертиз.
Совместно с Комитетом законодательства и судебно-правовой реформы Мажилиса Парламента Республики Казахстан 1-2 октября 2015 года проведен Международный юридический форум на тему: «Развитие института судебной экспертизы в условиях Евразийского экономического союза».
Международный юридический форум стал местом встречи известных правоведов, руководителей государственных органов и международных организаций, практикующихся юристов, представителей профессиональных сообществ для всестороннего и конструктивного обсуждения вопросов права, правоприменения и юридического образования на современном этапе развития общества.

Сейтенов Калиолла Кабаевич, доктор юридических наук, профессор, 1967 года рождения, национальность – казах, образование высшее юридическое.
1990-1994 гг. — окончил факультет по подготовке экспертов-криминалистов Волгоградской Высшей следственной школы МВД Российской Федерации. Специальность: юриспруденция. Квалификация: юрист, эксперт-криминалист. В 2004 году защитил в Казахском Гуманитарно-Юридическом Университете диссертацию па соискание ученой степени кандидата юридических наук. В 2010 году защитил докторскую диссертацию.
Автор более шестидесяти научных трудов, в том числе учебных и учебно-методических пособий, методических рекомендаций и научных статей.
Награжден:
Почетной грамотой Министерства внутренних дел Республики Казахстан;
Медалью «За отличную службу в МВД РК»;
Грамотой Агентства по борьбе с экономической и коррупционной преступностью (финансовая полиция) Республики Казахстан «Кызметтік мшдеттерін улгілі орындағаны, жоғары нәтижелерге кол жеткізгені ушін және Казақстан Республикасының Тәуелсіздік куні мерекелеуге байланысты»;
Нагрудным знаком МОН РК «Ы. Алтынсарин».
Опыт работы:
1994-1998 гг. — УВД Акмолинской области МВД РК. Заместитель начальника экспертно-криминалистического управления УВД Акмолинской области.
1998-1999 гг. — Акмолинский юридический колледж МВД РК. Доцент кафедры уголовного процесса и криминалистики Акмолинского юридического колледжа МВД РК.
1999-2000 гг.- Академия финансовой полиции МГД РК. Доцент кафедры уголовного процесса и криминалистики Академии финансовой полиции МГД РК.
2000-2001 гг. — МВД Республики Казахстан. Старший следователь Следственного департамента МВД Республики Казахстан.
С 2001 г. — по настоящее время:
— старший преподаватель, доцент кафедры уголовного судопроизводства и криминалистики КАЗГЮУ;
— заместитель заведующего кафедрой уголовного судопроизводства и криминалистики;
— декан факультета национального и международного права;
— декан факультета предпринимательского права;
— проректор-директор Высшей школы национального права КАЗГЮУ;
— директор Института судебной экспертизы Университета КАЗГЮУ.

Салиенко Василий Васильевич – 1959 года рождения, национальность – русский, образование высшее педагогическое.
1976-1981 гг. – обучался на общетехническом факультете Целиноградского Государственного Педагогического Института по специальности – учитель физики и трудового обучения.
Награжден:
Почетными грамотами Управления образования – 5;
Грамотами Управления образования – 11;
Почетной Грамотой ЦК ВЛКСМ «За строительство БАМа»;
Нагрудным знаком «За отличную службу в МВД РК»
Медалями III и II степени «За безупречную службу в органах внутренних дел РК»;
Почетной грамотой Министерства внутренних дел Республики Казахстан;
Благодарственным письмом МВД РК;
Медалью «За охрану общественного порядка»;
Медалью «Ветеран ОВД»;
Юбилейной медалью «80 лет оперативной службы».
Присвоены квалификации:
учитель физики высшей категории;
мастер-наставник МВД РК.
С 1993 по 1997гг. – депутат городского Маслихат-собрания депутатов г. Астаны.
Опыт работы:
1983-1992 гг. – учитель физики, трудового обучения, заместитель директора школы по военно-патриотическому воспитанию СШ № 17 и СШ № 7 г.Астаны;
1992-1996 гг. – директор СШ № 12 г. Астаны;
1996-1999 гг. – эксперт, старший криминалист ЭКО УГСК и ЭКУ УВД по Акмолинской области;
1999- 2012 гг. — главный криминалист Оперативно-криминалистического Департамента МВД Республики Казахстан.
С 2012 г. — по настоящее время:
— ведущий научный сотрудник ИСЭ.

Салюков Рустем Равильевич – 1961 года рождения, национальность татарин, образование высшее педагогическое.
1978 — 1983 гг., обучался на факультете математики и физики в Аркалыкском педагогическом институте по специальности учитель математики и физики.
Награжден:
Нагрудным знаком «За отличную службу в МВД РК»
Медалями III и II степени «За безупречную службу в органах внутренних дел РК»;
Почетной грамотой Министерства внутренних дел Республики Казахстан;
Благодарственным письмом МВД РК;
Медалью «За охрану общественного порядка».
Присвоена квалификация:
мастер-наставник МВД РК.
Опыт работы:
1983 — 1988 гг. –Областное управление хлебопродуктов: инженер технического отдела, инженер по ТБ, главный энергетик;
С 1988 по 2012 гг. – служба в органах внутренних дел: Инспекция по делам несовершеннолетних – инспектор; оперативно-технический отдел – старший оперуполномоченный по ОВД, начальник отдела; Оперативно-криминалистическое управление (департамент) МВД РК – криминалист, ст. криминалист, гл. криминалист, заместитель начальника управления — специализация эксперт-баллист;
С 2012 по настоящее время – старший научный сотрудник Института судебной экспертизы.

Лаборатория криминалистических и специальных видов исследований
Назначение лаборатории – лаборатория криминалистических и специальных видов исследований – предназначена для проведения почерковедческого исследования (идентификация личности исполнителя записей и подписей), технического исследования документов (установление признаков, свидетельствующих о технической подделке документа, выявлении невидимых записей, восстановление содержания поврежденных документов), а также идентификация личности человека по фотографии (портретные исследования) с помощью программно-технического комплекса «Растр».

Лаборатория судебно-баллистических исследований и холодного оружия

Назначение лаборатории – лаборатория предназначена для проведения исследований с целью установления вида, образца (модели) огнестрельного оружия по стреляным пулям, гильзам и следами выстрела,изъятых с мест происшествий, а также определения конкретного экземпляра оружия по стреляным пулям и гильзам с помощью Автоматизированной баллистической идентификационной системы (АБИС) «Арсенал». В данной лаборатории также проводятся исследования по установлению принадлежности к холодному оружию предметов, предназначенных для поражения цели (человека, животного, мишени) с использованием мускульной силы человека.

Лаборатория дактилоскопической регистрации, учетов и исследований

Назначение лаборатории – лаборатория предназначена для обучения слушателей способам обнаружения, фиксации и изъятию следов рук на месте происшествия, их хранения (создание баз данных) с помощью автоматизированных систем (АДИС «Папилон») и проведения исследований для идентификации конкретного человека по отображениям (следам) кожных покровов рук человека.

Кабинет для лекционных и семинарских занятий

Лаборатория для проведения экспериментальных исследований

Назначение лаборатории – в лаборатории расположен пулеулавливатель для отстрела огнестрельного оружия, а также установка «Скорость», позволяющая определять скорость полета пули. В лаборатории находятся стенды с необходимыми средствами и материалами для проведения лабораторных и практических работ.

Назначение полигона –предназначен для наглядного воспроизведения и проведения практических занятий по осмотру места происшествия следующих видов преступлений: убийство (самоубийство), кража, грабеж и разбой, захват заложников, изнасилование и др. Занятия проводятся со студентами университета, следователями, дознавателями и специалистами-криминалистами Министерства внутренних дел.  Для качественного образовательного процесса комнаты полигона условно обозначены и имеют различную направленность  обучения при производстве следственных действий. Квартира (условно) – имитация обстановки квартиры для проведения практических занятий по осмотру места происшествия по различным видам преступления (кража, убийство, изнасилование). Сберегательная касса (условно) – имитация обстановки офисного помещениядля проведения практических занятий по осмотру места происшествия по различным видам преступления (разбой, убийство, захват заложников). Сквер (условно) – имитация обстановки улицы, сквера для проведения практических занятий по осмотру места происшествия по различным видам преступления (убийство, грабеж, разбой).