Ежегодно Университет КАЗГЮУ участвует в открытом конкурсе по проведению фундаментальных научных исследований, организуемом Комитетом науки МОН РК. При этом традиционно выигрывали несколько грантов, так, в 2013 году выиграли 1 грант, в 2015 – 1 грантовая тема. В 2014 году были завершены исследования по 4 темам фундаментального исследования из средств государственного бюджета. Научными руководителями проектов являются ведущие доктора юридических наук, профессора Университета КАЗГЮУ. Результаты следующих фундаментальных исследований по линии Министерства образования и науки Республики Казахстан внедрены в учебный процесс и в практику работы государственных органов:

— правовое обеспечение вступления Казахстана во Всемирную торговую организацию. Охрана интеллектуальной собственности;

— соотношение международного и национального законодательства: проблемы имплементации;

— теоретические проблемы повышения эффективности законодательства Республики Казахстан в условиях политической модернизации и глобализации;

— актуальные проблемы дальнейшей гуманизации  уголовной политики (на основе декриминализации отдельных видов преступлений и депенализации наказаний);

— проблемы и перспективы совершенствования правового регулирования экономических отношений в Евразийском экономическом сообществе (ЕврАзЭС);

— проблемы истории юридической науки и создание энциклопедического биобиблиографического справочника «Видные ученые-юристы Казахстана ХХ начала ХХI вв.».